Η ΠΕΟ αποτελείται από 7 συντεχνίες που λειτουργούν σε επαρχιακό και κεντρικό επίπεδο.
ΠΑΣΕΥ: Καλύπτει εργαζόμενους στις υπηρεσίες σε κλάδους όπως η ιδιωτική εκπαίδευση όλων των βαθμίδων, τραπεζικά ιδρύματα, κοινωνικά ιδρύματα, ελεγκτικά και τουριστικά γραφεία, αεροδρόμια και άλλους συναφείς κλάδους.
ΠΑΣΥΕΚ: Καλύπτει το εργατικό και τεχνικό προσωπικό της κυβέρνησης, των δημόσιων νοσηλευτηρίων και των σχολικών εφορειών.
ΣΕΒΕΤΤΥΚ: Καλύπτει εργαζόμενους στο εμπόριο, βιομηχανία, τυπογραφεία, ιδιωτικές κλινικές, προσωπικό ασφαλείας κλπ.
ΣΕΓΔΑΜΕΛΙΝ: Καλύπτει εργαζόμενους στη γεωργία/ κτηνοτροφία, μεταφορές, ναυτικούς, λιμενεργάτες, πετρελαιοειδή, βιομηχανίες αναψυκτικών.
ΣΗΔΗΚΕΚ: Καλύπτει εργαζόμενους στου ημικρατικούς Οργανισμούς και την τοπική αυτοδιοίκηση.
ΣΥΞΚΑ: Καλύπτει εργαζόμενους σε ξενοδοχεία, εστιατόρια και κέντρα αναψυχής.
ΣΥΝΤΕΧΝΙΑ ΟΙΚΟΔΟΜΩΝ: Καλύπτει τους κλάδους των κατασκευών, μετάλλου και μηχανοτεχνιτών, ξυλουργών, μεταλλείων, τσιμεντοποιείων, και γενικών εργατών.
Ένωση Κυπρίων Συνταξιούχων (ΕΚΥΣΥ): παρά το ότι δεν είναι συντεχνία, συσπειρώνει στη δράση της χιλιάδες συνταξιούχους, διεκδικώντας βελτίωση του επιπέδου ζωής τους.
Γραφείο Γυναικών Εργατοϋπαλλήλων που είναι το αρμόδιο Γραφείο για τα ζητήματα ισότητας στην εργασία.
Γραφείο Εργατικής Νεολαίας που είναι αρμόδιο για ζητήματα που απασχολούν τους νέους εργαζομένους.
Γραφείο Μεταναστών που ασχολείται με τα ζητήματα που αντιμετωπίζουν οι μετανάστες στην εργασία, στη βάση της αρχής της ίσης μεταχείρισης, την καταπολέμηση των διακρίσεων, και της προστασίας των δικαιωμάτων τους.